Les mécanismes du processus d'agrégation sont encore sujets à controverse. D'après Gobat in Baize et al., 2013, les modèles les plus récents font l'hypothèse que les agrégats sont issus de l'absorption successives de matières organiques par les particules minérales de sol (< 250 µm) qui se combineraient pour donner des macro-agrégats (> 250 µm).
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